pcr-南京英瀚斯生物科技-pcr引物设计

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    2022-8-24

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15.测序发现引物有突变是怎么回事?

答:测序发现引物区域有突变,---是40个碱基以下的引物, 发生的概率不大,但是肯定也会发生。用户一般可以放心,引物序列一般都是通过电脑直接将您的序列copy到合成仪的,碱基输错的机会不多。---合成公司一般会有一套控制办法,预防碱基输入错误。发生这种突变的原因有很多解释,pcr实验室,人们还没有办法解决这个问题。引物合成的固相合成原理都一样,采用的机器也基本相同,合成主要原料都是由可数的几家跨国公司提供的,所有每个合成服务商遇到的问题也基本类似,没有人可以超脱。

引物合成是一种多步骤的化学反应,合成也就是99%,副产品不可以避免。引物序列中插入突变往往是碱基重复,一般认为,偶连过程中,正在偶连的部分单体发生丢失dmt,导致单体又接了上去,故发生插入同一碱基的突变。至于缺失突变,一般认为是一般认为是带帽(capping)反应不造成的,caping反应主要是封闭数5′----没有参加反应单体。---闭的引物,在下一轮偶连时将不能继续参与合成。对于碱基置换的突变,产生的原因一般认为是碱基不能100%脱保护,即引物上可能含有残留保护基团,引物的这些区域不能---地与互补链配对,当扩增的产品被亚转化到大肠中,可能被---中修复系统补上了非配对的碱基。置换突变通常发生在g 转换成其它碱基。碱基g在一定条件下可以转化为烯醇异构体 (脱呤),2,6 diaminopurine , dna和扩增过程中dna聚合酶将2,6 diaminopurine看作碱基a,pcr引物设计,测序就会发现碱基g-a置换。脱呤现象在富含呤的引物中发生的频率较高。脱呤的引物在引物后处理脱保护阶段如果被降解,测序就会发现碱基g或a的缺失。

引物合成过程中,造成碱基插入,缺失,置换突变的因素客观存在,有不少降低发生的频率建议和措施,但是这些措施还停留在实验室阶段,还没有能够应用到规模化生产中。






分子生物学服务

 公司建有100平米分子实验室,配备有pcr仪、定量pcr仪、电泳仪、恒温培养箱、恒温摇床、垂直电泳仪、蛋白转印仪、蛋白发光成像仪等设备。分子组---毕业于农业大学、华中科技大学同济医学院、浙江理工大学等高校生物医学相关,全部具有硕士研究生以上---,熟练掌握分子生物学相关实验,实时定量pcr,可开展多种分子生物学检测服务。













分子实验室部分设备






染色质免l疫共沉淀技术(chip)

基于体内分析而发展的染色质免l疫沉淀分析chr omat in immunoprecipitat ionassay kit, chip)技术可以真实、完整地反映结合在dna序列上的调控蛋白。由于chip采用甲醛固定活l细胞或者组织的方法,因此能比较真实的反映细胞内tf与promoter的结合情况,pcr,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。近年来,这种技术得到不断的发展和完善。采用结合微阵列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活性,是深入分析癌l症、心血l管病以及中央神经系统紊乱等---主要通路的一-种非常有效的工具。

染色质免l疫沉淀分析(chip) 的基本原理是在活l细胞状态下,当用甲醛处理时,相互靠近的蛋白与蛋白、蛋白与---(dna或rna)之间会产生共价键。细胞内,当f与promoter相互结合时,它们必然靠的比较近或者契合在一起,这个时候用甲醛处理,能使它们之间产生共价键。固定的蛋白质dna复合物通过超声或酶处理将其随机切断为-定长度范围内的染色质小片段然后通过抗原抗l体的特---识别反应沉淀此复合体,特---地富集目的蛋白结合的dnal片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与dna相互作用的信息。通过qpcr或二代测序,筛选与目的蛋白互作的未知dna信息。






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