lncrna测序
长链非编码rnas(long non-coding rnas,lncrnas)一般是指长度大于200 nt的rna,位于细胞核内或胞浆中,不参与蛋白质编码功能,以rna形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平,在生命活动中具有重要作用。
长链非编码rna测序(long non-coding rna sequencing,lncrna-seq)是一种使用特定方法降低样本中rrna 的丰度,对富集到的 rna进行---构建,再对高通量测序仪产出的数据进行信息分析的研究方法。lncrna-seq可---获得样本中全部的lncrnas信息,对lncrnas的类别、功能进行的深入分析,从而快速准确地获得与特定生物学过程(例如发育、---等)相关 lncrna信息。
线粒体测序
线粒体是真核生物的重要细胞器,是生物体的能量工厂,参与能量代谢、信号转导、细胞凋亡等许多生命活动,对生物的生理活动起着---的作用。大部分线粒体基因由于其母系遗传特性以及进化速率较快等特点,被广泛地用于种群遗传学、进化生物学、谱系地理学和系统发育学、---诊断等学科领域。线粒体全基因组在生物进化的研究中具有---的优势。由于线粒体有着与真核生物长期共生的进化历史,因此其基因组包含了反映物种进化的关键信息,同时,聚合酶链式反应(pcr)操作,相对于核基因组,线粒体基因组小,容易对大量物种进行横向的比较分析,有利于生物进化的研究,因而受到进化生物学家的---。线粒体的组成可以从两个层面上反映物种及群体的遗传和进化,即---序列组成和基因组的结构特征,两者的特征具有不同的进化机制和进化速度,在进化生物学研究中可以---的互补。
emsa实验
emsa:凝胶迁移或电泳迁移率检测是一种检测蛋白质和dna序列相结合的技术,初用于研究dna结合蛋白和其相关的dna结合序列相互作用,可用于定性和定量分析。分为2种类型:同位素标记探针,非同位素标记探针。
通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32p同位素标记的dna或rna探针一同保温,在非变性的聚bing烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针。dna-复合物或rna-复合物比非结合的探针移动得慢。同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,可是双链或者是单链。当检测如转录调控因子一类的dna结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽提液。在检测rna结合蛋白时,依据目的rna结合蛋白的位置,可用纯化或部分纯化的蛋白,也可用核或胞质细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的dna或rn片duan和gua核苷酸片段(特异),和其它非相关的片段(非特异),来确定dna或rna结合蛋白的特---。在竞争的特异和非特异片段的存在下,依据复合物的特点和强度来确定特异结合。
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