dna测序检测
1. pcr测序反应
(1)取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:
所加试剂测定模板管标准对照管
bigdye mix
1μl
1μl
待测的质粒dna
1μ 1
pgem-3zf (+)双链dna
-1μ1
待测dna的正向引物
1μ 1
m13(-21)引物- 1μ 1
灭菌去离子水
2μ 1
2μ 1
总反应体积5μ 1,不加轻矿物油或石蜡油,盖紧pcr管,用手指弹管混匀,稍离心。
(2)将pcr管置于9600或2400型pcr仪.上进行扩增。98c变性2min后进行pcr循环,
pcr循环参数为96c 10s, 50c 5s, 60°c4min, 25 个循环,扩增结束后设置4c保温。
2.---法纯化pcr产物
(1) 将混合物离心,将扩增产物转移到1.5ml ep管中。
(2)加入25μ 1/---混合液,充分振荡,置冰上10min以沉淀dna。12 000r/min于
4c离心30 min,小心弃上清。
(3)加70%(v/v)的---50μ 1 洗涤沉淀2次。12 000r/min 于4c离心5min,小心弃上清和
管壁的液珠,真空干燥沉淀10~ 15min。
3.电泳前测序pcr产物的处理。
(1)加入12μ 1的tsr于离心管中,剧烈振荡,腺---包装操作,让其充分溶解dna沉淀,稍离心。
(2)将溶液转移至盖体分离的0.2ml pcr管中,稍离心。
(3)在pcr仪上进行热变性(95c 2min),冰中骤冷,待_上机。
4..上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立
运行的测序顺序文件。
5.仪器将自动进行序列分析,并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知,可通过
序列比较以星号标出差异碱基处,提高工作效率。
6.测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与保养。
基因组甲l基化水平(methyl ati on content)的分析:
1.高l效液相色谱(hi gh-performanceli qui dchromatography, hplc)hplc是- -种比较传统的方法,是根据dna或蛋白分子量和构象的不同而使其加以分离。由于在动态相和静态相下分子的光吸收度并不相同而加以定量。随着系统的压强的增加,其分辨率增l高。故而能够定量测定基因组整体水平dna甲l基化水平。该方法由ruo等1980年首l次---。过程是将dna样品先经---或氢l氟酸水解成碱基,水解产物通过色谱柱,结果与标准品比较,用紫外光测定吸收峰值及其量,计算5 mc/(5mc+5c)的积分面积就得到基因组整体的甲l基化水平。这是一种检测dna甲l基化水平的标准方法。
2.高l效毛细管电泳法(hi gh-per formance capillary electrophoresis, hpce)这是一-种利用窄孔熔融石英毛细管来从复合物中分离不同化学组分的技术。其基础是在强电场下不同分子的由于其所带电荷,大小,结构以及疏水性等不同而相互分开。用hipce方法处理dna水解产物来确定5mc水平,简便,经济且敏感性高。
分子生物学检测
分子生物学作为现代生物技术中zui为---的实验手段之一,已经广泛渗透到生命科学的各个领域,在基础研究、医l疗诊断等领域均起到了非常重要的作用。
借助---技术优势,英瀚斯生物特配备了高l效的仪器设备,如slan 48p 荧光定量pcr检测系统、pcr仪、电泳仪、冷冻离心机、高速离心机等。目前公司可为您提供反转录pcr、荧光定量pcr、凝胶电泳迁移率等检测服务,---缩短您的实验周期、降低您的实验成本。
腺相关---包装操作-英瀚斯(在线咨询)由南京英瀚斯生物科技有限公司提供。南京英瀚斯生物科技有限公司是从事“组织病理,细胞生物,分子生物学平台,动物模型医学科研外包服务”的企业,公司秉承“诚信经营,用心服务”的理念,为您提供高的产品和服务。欢迎来电咨询!联系人:戴经理。
联系我们时请一定说明是在100招商网上看到的此信息,谢谢!
本文链接:https://tztz316162.zhaoshang100.com/zhaoshang/219304479.html
关键词: