常州检测-英瀚斯-荧光定量pcr检测

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    2020-12-3

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lncrna测序

长链非编码rnas(long non-coding rnas,lncrnas)一般是指长度大于200 nt的rna,位于细胞核内或胞浆中,不参与蛋白质编码功能,以rna形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平,在生命活动中具有重要作用。

长链非编码rna测序(long non-coding rna sequencing,lncrna-seq)是一种使用特定方法降低样本中rrna 的丰度,对富集到的 rna进行---构建,再对高通量测序仪产出的数据进行信息分析的研究方法。lncrna-seq可---获得样本中全部的lncrnas信息,对lncrnas的类别、功能进行的深入分析,从而快速准确地获得与特定生物学过程(例如发育、---等)相关 lncrna信息。










分子与质粒载体构建


实验原理

外源dna与载体分子的连接就是dna重组,这样重新组合的dna叫做重组体或重组子。重组的dna分子是在dna连接酶的作用下,有mg2+、atp存在的连接缓冲系统中,将分别经酶切的载体分子与外源dna分子进行连接。dna连接酶有两种:t4噬菌体dna连接酶和大肠dna连接酶。两种dna连接酶都有将两个带有相同粘性末端的dna分子连在一起的功能,crispr-cas9---包装,而且t4噬菌体dna连接酶还有—种大肠连接酶没有的特性,即能使两个平末端的双链dna分子连接起来。但这种连接的效率比粘性末端的连接效率低,一般可通过提高t4噬菌体dna连接酶浓度或增加dna浓度来提高平末端的连接效率。

t4噬菌体dna连接酶催化dna连接反应分为3步:,t4dna连接酶与辅助因子atp形成酶—amp复合物;然后,酶—amp复合物再结合到具有5’磷酸基和3’---切口的dna上,常州检测,使dna腺苷化;后产生一个新的磷酸二酯键,把切口封起来。

dna重组的方法主要有粘端连接法和平端连接法,为了防止载体本身的自连,可以通过(牛碱性磷酸酶)cip处理克服。

连接反应的温度在37℃时有利于连接酶的活性.但是在这个温度下,粘性末端的氢键结合是不稳定的。因此人们找到了一个折中温度,即12-16℃,连接12-16h(过夜),mirna合成,这样既可大限度地发挥连接酶的活性,又---到短暂配对结构的稳定。




动物组织细胞基因组dna提取

操作步骤

1. 取新鲜或冰冻动物组织块0.1g(0.5cm3),尽量剪碎。置于玻璃匀浆器中,加入1ml的细胞裂解缓冲液匀浆至不见组织块,转入1.5ml 离心管中,加入蛋白酶k

(500ug/ml)20μl,混匀。在65℃恒温水浴锅中水浴30min,也可转入37℃水浴12~24h,荧光定量pcr检测,间歇振荡离心管数次。于台式离心机以12000 rpm离心5min,取上清液入另

一离心管中。

2.加2倍体积异,倒转混匀后,可以看见丝状物,用100ul 吸头挑出,凉干,用200ul te 重新溶解。(可进行pcr反应等,需要进一步纯化的按下列步骤进行)

3.加等量的酚??振荡混匀,离心12000 rpm,5min。

4.取上层溶液至另一管,加入等体积的?,振荡混匀,离心12000 rpm,5min。

5. 取上层溶液至另一管,加入1/2体积的7.5mol/l氨加入2倍体积的无水---,混匀后室温沉淀2min ,离心12000 rpm ,10min。

6.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上,将附于管壁的残余液滴除掉。

7.用1ml 70%---洗涤沉淀物1次,离心12000 rpm , 5min。

8.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上,将附于管壁的残余液滴除掉,室温干燥。

9.加200ul te重新溶解沉淀物,然后置于4℃或?c20℃保存备用。

10.吸取适量样品于genequant上检测浓度和纯度。





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