英瀚斯-实时荧光定量pcr-咸阳pcr

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    2022-6-12

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rna提取及注意事项



研究基因的表达和调控时,需要从组织或细胞中分离纯化rna。rna的高低经常影响rt-pcr、cdna库构建和northern blot等分子生物学实验的成败。

主要试剂

trizol是一种新型总rna抽提试剂,内含异---胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的---酶。

1.

trizol试剂含有,具有毒性和---性,注重操作。

2.

rnase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。

3. 细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低后得率,因为一部分rna会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源rnase降解了rna。

4. 酵母和一些---由于细胞壁的---结构,可以加入trizol试剂同时加入无rnase的玻璃珠并剧烈振荡,使细胞裂解充分。

2-8℃ 避光保存一年。






外显子测序

外显子组测序(exome-seq)是对定向富集的基因组dna进行高通量测序,它能够以相对低的费用对人类外显子组进行拷问。2009年,外显子组捕获工具的出现,让外显子组测序这种技术迅速红起来。到目前为止,已有超过1万个外显子组被测序。

如今有多家公司推出了外显子组捕获试剂,包括罗氏nimblegen、安捷伦、illumina,还有现在的华大基因。这些方法究竟孰优孰劣,斯坦福大学医学院遗传学系的研究人员对市场上三个主流的外显子组测序平台进行了比较。该研究结果发表在上。研究人员利用安捷伦、illumina和nimblegen的外显子组测序平台对同一个人类---样品进行分析。他们的结 果表明,nimblegen平台作为一个使用高密度重叠探针的平台,尽管覆盖了较少的基因组区域,---怎么做,但在灵敏检测小的变异时所需的测序量也少。在同样获得80m测序数据的情况下,fish检测,nimblegen有97%的目标序列达到10x以上的测序---,而其他产品只有90%。而安捷伦和illumina的探针能够在低密度下捕获更多数量的变异。此外,illumina还捕获了未翻译的区域,这是nimblegen和安捷伦平台无法靶定的。研究人员还比较了同一样品的外显子组测序和全基因组测序(wgs),显示外显子组测序能够检测到wgs错过的小变异。

除了文中提到了三个主流平台,咸阳pcr,外显子组捕获方面的新产品也在不断推出,实时荧光定量pcr,研究人员的选择也将更广泛。罗氏nimblegen即将推出新一代的外显子液相捕获产品。这一新产品将可捕获64m的基因组序列,包括外显子以及mirna,它含与其他nimblegen液相捕获产品相同的2.1m高密度探针,以高xiao、均一、特异、的定向捕获。






分子实验介绍——荧光检测

细胞荧光染色是以荧光物质标记而进行抗原定位的技术。在细胞中,通过特定的标记,可以检测目的蛋白表达量和表达定位。是细胞中的可直观观察细胞内蛋白定位和表达的实验方法。

实验流程:细胞固定-细胞膜破膜-蛋白封闭-目的蛋白结合-荧光二抗结合-dapi染色-荧光显微镜拍照或激光共---显微镜拍照。

结果示例:





细胞荧光染

通过观察细胞中蛋白的荧光强度和定位分析该蛋白的表达变化。


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