蛋白质双向电泳实验流程
1.---yi酸-bing酮沉淀法提取蛋白
2.双向电泳分离待测样品
(1)一相等电---前处理按照所用仪器的厂商提供操作手册进行。蛋白质上样浓度不要超过10mg/ml,否则会造成蛋白质的---或沉淀。
(2)等电---完毕后(约需24hr),若不立即进行第二相电泳,胶条可夹在两层塑料薄膜中于-70℃保存数月。
(3)等电---好的胶条按厂商提供的操作手册平衡两次。平衡完毕后,---,于电泳仪上用12.5%sds-page凝胶进行电泳分离。仪器设置为2.5w/胶 45min,15w/胶 5-8hr,20℃。
3.银染法对凝胶进行染色
(1)固定(2)清洗(3)增敏(4)清洗(5)染色(6)清洗(7)显影(8)定影(9)水洗
3.凝胶扫描及图像分析
(1)图像扫描:凝胶染色后采用image scanner以300dpi,16-bit模式(65536灰阶)进行扫描。
(2)图像分析:扫描完毕后,凝胶继续置于1%yi酸中于4℃保存。扫描后的图像用imagemaster 2d platinum software软件进行分析。分析按照软件厂商提供的说明书进行。以zui小点面积30,平滑度2为主要参数zui大限度检测蛋白质点。以目标蛋白质3个重复具有相同趋势,目标蛋白质相邻位点的相对一致性,至少2个重复有2倍以上差异作为判定差异表达蛋白质的标准。
分子实验介绍——荧光检测
细胞荧光染色是以荧光物质标记而进行抗原定位的技术。在细胞中,通过特定的标记,可以检测目的蛋白表达量和表达定位。是细胞中的可直观观察细胞内蛋白定位和表达的实验方法。
实验流程:细胞固定-细胞膜破膜-蛋白封闭-目的蛋白结合-荧光二抗结合-dapi染色-荧光显微镜拍照或激光共---显微镜拍照。
结果示例:
细胞荧光染
通过观察细胞中蛋白的荧光强度和定位分析该蛋白的表达变化。
关于引物的常见问题汇总:
1. 引物是如何合成的?
目前引物合成基本采用固相亚---胺三酯法。dna合成仪有很多种, 主要都是由abi/pe 公司生产,而bioneer自行研制的384并行高通量dna合成仪,可实现99%的高合成率。无论采用什么机器合成,pcr,合成的原理都相同,主要差别在于合成产率的高低,试剂消耗量的不同和单个循环用时的多少。
亚---胺三酯法合成dna,具有、快速的偶联以及起始反应物比较稳定的特点。亚---胺三酯法是将dna固定在固相载体上完成dna链的合成的,合成的方向是由待合成引物的3′端向5′端合成的,相邻的核苷酸通过3′***5′磷酸二酯键连接。
步是将预先连接在固相载体cpg上的活性基团被保护的核苷酸与---反应,脱去其5′----的保护基团dmt,获得游离的5′----。
第二步,合成dna的原料,亚---胺保护核苷酸单体,与活化剂四氮唑混合,得到核苷亚磷酸活化中间体,它的3′端被活化,5′----仍然被dmt保护,与溶液中游离的5′----发生缩合反应。
第三步,带帽(capping)反应,缩合反应中可能有数5′----没有参加反应(少于2%),用酐和1-咪唑终止其后继续发生反应,这种短片段可以在纯化时分离掉。
第四步,pcr引物设计,在氧化剂碘的作用下,亚---形式转变为更稳定的磷酸三酯。
经过以上四个步骤,一个脱氧核苷酸被连接到固相载体的核苷酸上。再以---脱去它的5′----上的保护基团dmt,重复以上步骤,直到所有要求合成的碱基被接上去。合成过程中可以观察tca处理阶段的颜色判定合---率。
通过---高温处理,pcr,连接在cpg上的引物被切下来,通过opc,和page等手段纯化引物,成品引物用c18浓缩、脱盐,沉淀。沉淀后的引物用水悬浮,测定od260定量,根据定单要求分装。
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