---怎么做-英瀚斯生物科技公司-上海pcr

dna测序检测

1. pcr测序反应

(1)取0.2ml的pcr管，用记号笔编号，将管插在颗粒冰中，按下表加试剂:

所加试剂测定模板管标准对照管

bigdye mix

1μl

1μl

待测的质粒dna

1μ 1

pgem-3zf (+)双链dna

-1μ1

待测dna的正向引物

1μ 1

m13(-21)引物- 1μ 1

灭菌去离子水

2μ 1

2μ 1

总反应体积5μ 1，不加轻矿物油或石蜡油，盖紧pcr管，用手指弹管混匀，稍离心。

(2)将pcr管置于9600或2400型pcr仪.上进行扩增。98c变性2min后进行pcr循环，

pcr循环参数为96c 10s， 50c 5s， 60°c4min， 25 个循环，扩增结束后设置4c保温。

2.---法纯化pcr产物

(1) 将混合物离心，将扩增产物转移到1.5ml ep管中。

(2)加入25μ 1/---混合液，充分振荡，置冰上10min以沉淀dna。12 000r/min于

4c离心30 min，小心弃上清。

(3)加70%(v/v)的---50μ 1 洗涤沉淀2次。12 000r/min 于4c离心5min，小心弃上清和

管壁的液珠，真空干燥沉淀10~ 15min。

3.电泳前测序pcr产物的处理。

(1)加入12μ 1的tsr于离心管中，剧烈振荡，让其充分溶解dna沉淀，稍离心。

(2)将溶液转移至盖体分离的0.2ml pcr管中，稍离心。

(3)在pcr仪上进行热变性(95c 2min)，冰中骤冷，待_上机。

4..上机操作按仪器操作说明书安装毛细管，进行毛细管位置的校正，人工手动灌胶和建立

运行的测序顺序文件。

5.仪器将自动进行序列分析，并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知，可通过

序列比较以星号标出差异碱基处，提高工作效率。

6.测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与保养。

5.长可以合成多长的引物？

答：引物越长，出现问题的概率就越大。有的公司合成过120base的引物，---多少钱，产率很低。除非需要，建议合成片段长度不要超过80mer，按照目前的引物合---率，80mer的粗产品，全长（还不一定正确）引物的百分比不会超过40%，后续处理还有丢失很多，的产量很低。

6.需要合成多少od数？

答：根据实验目的确定。一般pcr扩增，pcr检测，2 od引物，可以做200-500次50ul标准pcr反应。如果是做基因拼接或退火后做连接，上海pcr，1 od就足够了。但是有些研究人员，就做几次pcr，---怎么做，但是却要5-10 od。做全基因构建的引物都比较长，但是我们有些研究人员也要求高od数。片段越长， 全长得率就越低，出错的几率就越大。超出需要之外的od数要求，其实也是对社会资源的一种浪费，同时也从一个侧面反映了部分研究人员---是新手的自信心不足，总觉得需要重复多次才能成功。