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    2023-10-9

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分子与质粒载体构建


实验原理

外源dna与载体分子的连接就是dna重组,这样重新组合的dna叫做重组体或重组子。重组的dna分子是在dna连接酶的作用下,有mg2+、atp存在的连接缓冲系统中,将分别经酶切的载体分子与外源dna分子进行连接。dna连接酶有两种:t4噬菌体dna连接酶和大肠dna连接酶。两种dna连接酶都有将两个带有相同粘性末端的dna分子连在一起的功能,而且t4噬菌体dna连接酶还有—种大肠连接酶没有的特性,即能使两个平末端的双链dna分子连接起来。但这种连接的效率比粘性末端的连接效率低,一般可通过提高t4噬菌体dna连接酶浓度或增加dna浓度来提高平末端的连接效率。

t4噬菌体dna连接酶催化dna连接反应分为3步:,---怎么做,t4dna连接酶与辅助因子atp形成酶—amp复合物;然后,实时荧光定量pcr,酶—amp复合物再结合到具有5’磷酸基和3’---切口的dna上,使dna腺苷化;后产生一个新的磷酸二酯键,把切口封起来。

dna重组的方法主要有粘端连接法和平端连接法,为了防止载体本身的自连,可以通过(牛碱性磷酸酶)cip处理克服。

连接反应的温度在37℃时有利于连接酶的活性.但是在这个温度下,粘性末端的氢键结合是不稳定的。因此人们找到了一个折中温度,即12-16℃,连接12-16h(过夜),这样既可大限度地发挥连接酶的活性,又---到短暂配对结构的稳定。





分子实验介绍——印迹(western blot)检测

通过sds-page凝胶将细胞或生物样品内的蛋白按照蛋白分子量从大到小规律分离开。经过page分离的蛋白质样品,乐山pcr,转移到固相载体(例如纤维素薄膜或pvdf膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,---,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的起反应,再与酶或同位素标记的第二起反应(目前主要用hrp标记的第二),经过底物显色或自显影以检测电泳分离的特---目的基因表达的蛋白成分(目前主要使用鲁米诺和二---的hrp反应发出荧光,通过仪器或者胶片显色)。该技术广泛应用于检测蛋白水平的表达。

实验流程:细胞收集-细胞裂解,蛋白提取-蛋白变性-sds-page电泳-蛋白质转膜印记-蛋白封闭-目的孵育-二抗孵育-显色拍照

结果示例:





图 a不同大小的质粒转染细胞后,western blot检测图片;b a蛋白不同培养时间后western blot检测图片;c 使用image pro plus软件对a蛋白灰度检测,a蛋白表达变化统计图


dna测序检测

1. pcr测序反应

(1)取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:

所加试剂测定模板管标准对照管

bigdye mix

1μl

1μl

待测的质粒dna

1μ 1

pgem-3zf (+)双链dna

-1μ1

待测dna的正向引物

1μ 1

m13(-21)引物- 1μ 1

灭菌去离子水

2μ 1

2μ 1

总反应体积5μ 1,不加轻矿物油或石蜡油,盖紧pcr管,用手指弹管混匀,稍离心。

(2)将pcr管置于9600或2400型pcr仪.上进行扩增。98c变性2min后进行pcr循环,

pcr循环参数为96c 10s, 50c 5s, 60°c4min, 25 个循环,扩增结束后设置4c保温。

2.---法纯化pcr产物

(1) 将混合物离心,将扩增产物转移到1.5ml ep管中。

(2)加入25μ 1/---混合液,充分振荡,置冰上10min以沉淀dna。12 000r/min于

4c离心30 min,小心弃上清。

(3)加70%(v/v)的---50μ 1 洗涤沉淀2次。12 000r/min 于4c离心5min,小心弃上清和

管壁的液珠,真空干燥沉淀10~ 15min。

3.电泳前测序pcr产物的处理。

(1)加入12μ 1的tsr于离心管中,剧烈振荡,让其充分溶解dna沉淀,稍离心。

(2)将溶液转移至盖体分离的0.2ml pcr管中,稍离心。

(3)在pcr仪上进行热变性(95c 2min),冰中骤冷,待_上机。

4..上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立

运行的测序顺序文件。

5.仪器将自动进行序列分析,并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知,可通过

序列比较以星号标出差异碱基处,提高工作效率。

6.测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与保养。





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