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    2023-11-23

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16.长链引物为什么出错的几率非常高?

答:引物合成时,每一步反应效率都不能达到100%,产生碱基插入、缺失、置换突变的因素客观条件都有一直存在。引物链越长,突变的频率累加起来就越高。研究人员总希望合成的引物万无一失,这种心情可以理解。但是---pcr扩增,不可能---扩增产物中没有突变,引物合成也不可能---100%正确。要知道,引物合成中发生错误(非人为因素)的频率,比任何高保---温聚合酶pcr扩增过程所产生的频率都要高。做引物合成,长链引物合成,您要有引物中部分引物可能有突变的思想准备。


17.如果测序发现突变,该如何处理?

答:遇到这种情况,首先和---合成厂家取得联系,生产人员会检查生产的原始记录,主要是核对合成序列是否和定单一致,pcr引物设计,他们在电脑中一般会保留所有原始数据。在确认引物合成序列没有输错的情况下,眉山pcr,建议重新挑取测序,可能会找到正确的。根据经验,40个碱基以下的引物,测1-2个就可以了;40个以上的---是用于全片段拼接合成的,就需要多测一些了。一般情况下,每个突变的位点都不一样,提示正确的总是有的,就是如何找到它。也可以要求公司将引物免费重合一次,不过重合的引物和次的引物一样,都可能含突变,荧光定量pcr,不会因为重合的引物就减少您的遇到问题的几率。基因拼接过程中,如果发现一段区域突变点不多,就多测几个,否则就重合一下引物。







单细胞rna测序

单细胞rna测序也称scrna-seq。通常而言,一般的组织细胞rna-seq实验会产生1000万个读数,如果一个基因的频率超过50rpkm,即每百万读数中每千个碱基中超过50个,这一基因即被认为有表达。泊松分布下,1kb长的基因有超过500个读数和4%的小变异系数,即cv值;哺乳动物细胞通产含有200,000个mrna,因此至少要用50个单细胞一起才能到达小cv值;考虑到逆转录的效率和环境干扰等因素,为得到准确的表达和细胞种类的识别,需要使用的细胞数量实际要更多。





emsa实验

emsa:凝胶迁移或电泳迁移率检测是一种检测蛋白质和dna序列相结合的技术,初用于研究dna结合蛋白和其相关的dna结合序列相互作用,可用于定性和定量分析。分为2种类型:同位素标记探针,非同位素标记探针。

通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32p同位素标记的dna或rna探针一同保温,在非变性的聚bing烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针。dna-复合物或rna-复合物比非结合的探针移动得慢。同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,可是双链或者是单链。当检测如转录调控因子一类的dna结合蛋白,可用纯化蛋白,部分纯化蛋白,或核细胞抽提液。在检测rna结合蛋白时,pcr检测,依据目的rna结合蛋白的位置,可用纯化或部分纯化的蛋白,也可用核或胞质细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的dna或rn片duan和gua核苷酸片段(特异),和其它非相关的片段(非特异),来确定dna或rna结合蛋白的特---。在竞争的特异和非特异片段的存在下,依据复合物的特点和强度来确定特异结合。





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