22.同样的od用page检测,eb染色为什么深浅不一?
答:通常可以用eb染色的方法来判断双链dna的量(如质粒dna),因为eb可以嵌合到双链dna中。而合成的单链dna,由于碱基组成不同,形成二级结构的可能性不同,eb的染色程度也会有差异,比如oligo(dt)等不形成二级结构,eb染色效果就非常差。所以不要用eb染色的方法来定量,而用紫外分光光度计检测。同样道理,---,用eb染色来照片不适合所有引物。
23.引物不纯会有什么后果?
答:引物不纯可能会导致:1)非特---扩增;2)无法用预先设计在引物5′端酶切位点的酶切开,pcr引物设计,---是没有保护碱基的引物;3) 用于测序出现双峰或乱峰。解决办法重新合成或重新纯化。
24.已经溶解的引物,为什么原先使用正常,而过一段时间再使用就不好了?
答:如果溶解引物的水ph过低或污染了菌或---酶,会使引物降解。使用时没有充分解冻混合,液体不均匀也可能会造成引物加入量不准确。建议分装引物,避免反复冻溶。建议使用10mmt ris ph7.5缓冲液溶解引物,因为有些蒸馏水的ph值比较低(ph4-5), 引物在这种条件下不稳定。还有一种可能性是引物没有问题,而是pcr使用材料---是模板的与先前使用的不完全一致。
7.如何检测引物的纯度?
答:实验室方便的作法是用page方法。使用加有7m尿素的16%的聚---凝胶进行电泳。取0.2-0.5od的引物,用尿素饱和液溶解或引物溶液中加入尿素干粉直到饱和,上样前加热变性(95℃,2mins)。加入尿素的目的一是变性,二是增加样品比重,容易加样。600v电压进行电泳,一定时间后(约2-3小时),剥胶,用荧光tlc板在紫外灯下检测带型,在主带之下没有杂带,说明纯度是好的。如果条件许可,也可以用eb 染色或银染方式染色。
而有的厂家提供maldi-tof质谱qc控制,从而保障了合成的准确率:
bioneer使用多重maldi-tof质谱仪进行全自动装载及监测。 每份样品的质谱分析数据将自动插入到寡核苷酸的信息单中。bioneer是上仅有的几个对生产的每份核苷酸 (单个寡核苷酸和高通量和成) 都用maldi-tof质谱仪检测进行核苷酸qc检测的厂商,荧光定量pcr,而且免费提供质谱数据。
8.如何计算引物的浓度?
答:引物保存在高浓度的状况下比较稳定。引物一般配制成10-50pmol/ul。 一般情况下,建议将引物的浓度配制成50pmol/ul,加水的体积(微升)按下列方式计算:v (微升)= od数*(乘)33 *(乘)*(乘)20000 / (除) 引物的分子量。引物的分子量可以从合成报告单上获得。如果需要配制成其他浓度,按上述公式换算。
注意:1 od260= 33 ug/ml.
3、参数设置
使用488nm激发波长,525nm发射波长,实时或逐时间点检测---前后荧光的强弱。dcf的荧光光谱和fitc非常相似,可以用fitc的参数设置检测dcf。dcf的激发光谱和发射光谱参考下图。
4、其它说明
阳性对照可以按照1:1000的比例使用。例如装载好探针的细胞共1毫升,可以加入1微升的阳性对照---。通常---后20-30分钟内可以观察到非常---的活性氧水平升高。对于不同的细胞,活性氧阳性对照的效果可能有较大的差别。如果在---后30分钟内观察不到活性氧的升高,可以适当提高活性氧阳性对照的浓度。如果活性氧升高得过快,pcr,可以适当降低活性氧阳性对照的浓度。
另外,对于某些细胞,如果发现没有---的阴性对照细胞荧光也比较强,可以按照1:2000-1:5000稀释dcfh-da,使装载探针时dcfh-da的浓度为2-5微摩尔/升。探针装载的时间也可以根据情况在15-60分钟内适当进行调整。
荧光定量pcr-pcr-英瀚斯由南京英瀚斯生物科技有限公司提供。南京英瀚斯生物科技有限公司是从事“组织病理,细胞生物,分子生物学平台,动物模型科研外包服务”的企业,公司秉承“诚信经营,用心服务”的理念,为您提供---的产品和服务。欢迎来电咨询!联系人:戴经理。
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