pcr-南京英瀚斯生物科技-pcr引物设计

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7.如何检测引物的纯度?

答:实验室方便的作法是用page方法。使用加有7m尿素的16%的聚---凝胶进行电泳。取0.2-0.5od的引物,pcr,用尿素饱和液溶解或引物溶液中加入尿素干粉直到饱和,上样前加热变性(95℃,2mins)。加入尿素的目的一是变性,二是增加样品比重,容易加样。600v电压进行电泳,一定时间后(约2-3小时),剥胶,用荧光tlc板在紫外灯下检测带型,在主带之下没有杂带,说明纯度是好的。如果条件许可,也可以用eb 染色或银染方式染色。

而有的厂家提供maldi-tof质谱qc控制,从而保障了合成的准确率:

bioneer使用多重maldi-tof质谱仪进行全自动装载及监测。 每份样品的质谱分析数据将自动插入到寡核苷酸的信息单中。bioneer是上仅有的几个对生产的每份核苷酸 (单个寡核苷酸和高通量和成) 都用maldi-tof质谱仪检测进行核苷酸qc检测的厂商,而且免费提供质谱数据。

8.如何计算引物的浓度?

答:引物保存在高浓度的状况下比较稳定。引物一般配制成10-50pmol/ul。 一般情况下,建议将引物的浓度配制成50pmol/ul,加水的体积(微升)按下列方式计算:v (微升)= od数*(乘)33 *(乘)*(乘)20000 / (除) 引物的分子量。引物的分子量可以从合成报告单上获得。如果需要配制成其他浓度,pcr引物设计,按上述公式换算。

注意:1 od260= 33 ug/ml.






二、大肠菌群检验方法:

由于大肠菌群指的是具有某些特性的一组与粪便污染有关的---,即:需氧及兼性厌氧、在37°c能分解乳糖产酸产气的革兰氏阴性无芽胞。因此大肠菌群的检测一般都是按照它的定义进行。 目前国内采用的进出口食品大肠菌群检测方法主要有和原商检局制订的行业标准。两个标准方法在检测程序上略有不同。

(一):采用三步法,即:乳糖发酵试验、分离培养和证实试验。乳糖发酵试验:样品稀释后,选择三个稀释度,每个稀释度接种三管乳糖胆盐发酵管。36士1c培养48土2h,观察是否产气。分离培养:将产气发酵管培养物转种于伊红美蓝琼脂平板上,36士1°c培养18-24h,pcr实验室,观察菌落形态。证实试验:挑取平板上的菌落,进行革兰氏染色观察。同时接种乳糖发酵管36士1°c培养24土2h,观察产气情况。

报告:

根据证实为大肠阳性的管数,查mpn表,报告每100ml ( g)大肠菌群的mpn值。具体操作参见gb4789. 3-94 <------食品卫生微生物学检验大肠菌群测定>

(二)原商检局制订的行业标准,等效采用美国fda的标准方法,用于对出口食品中的大肠进行检测。本方法采用两步法:推测试验:样品稀释后,选择三个稀释度,每个稀释度接种三管lst肉汤。36士1c培养48士2h,观察是否产气。证实试验:将产气管培养物接种煌绿乳糖胆盐(bglb)肉汤管中,36士1°c培养48士2h,观察是否产气。以bglb产气为阳性。查mpn表,报告每ml(g)样品中大肠菌群的mpn值。具体操作参见sn0169-92<------进出口商品检验行业标准 出口食品中大肠菌群、粪大肠菌群和大肠检验方法>






分子实验介绍——印迹(western blot)检测

通过sds-page凝胶将细胞或生物样品内的蛋白按照蛋白分子量从大到小规律分离开。经过page分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如纤维素薄膜或pvdf膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,pcr,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的起反应,再与酶或同位素标记的第二起反应(目前主要用hrp标记的第二),经过底物显色或自显影以检测电泳分离的特---目的基因表达的蛋白成分(目前主要使用鲁米诺和二---的hrp反应发出荧光,通过仪器或者胶片显色)。该技术广泛应用于检测蛋白水平的表达。

实验流程:细胞收集-细胞裂解,蛋白提取-蛋白变性-sds-page电泳-蛋白质转膜印记-蛋白封闭-目的孵育-二抗孵育-显色拍照

结果示例:






图 a不同大小的质粒转染细胞后,western blot检测图片;b a蛋白不同培养时间后western blot检测图片;c 使用image pro plus软件对a蛋白灰度检测,a蛋白表达变化统计图


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