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25.pcr扩增不出就引物有问题吗?

答:基本不是。当今发展出各色各样的pcr扩增技术,陕西pcr,各色各样的高温聚合酶,就是来解决pcr扩增中遇到的扩不出、扩增效率低的问题。如巢式pcr就是扩增那些拷贝数很低的基因片段。 有些重复片段的扩增, gc含量高的片段,非要采用特殊扩增手段才能扩增出了。

引物扩增不出,主要是下列两种情况比较常见:

(1) rt-pcr。请注意,很多基因通过常规rt -pcr方法是很难扩增出来的。 rt- pcr成功的关键在于rt的反应的rna和目标基因在特定组织和细胞中含量。

(2)从基因组中扩增。一般情况下,基因在基因组中都是单拷贝,基因组作为模板需要严格控制用量。基因组dna过高,会影响反应体系中的mg和ph





染色质免l疫共沉淀技术(chip)

基于体内分析而发展的染色质免l疫沉淀分析chr omat in immunoprecipitat ionassay kit, chip)技术可以真实、完整地反映结合在dna序列上的调控蛋白。由于chip采用甲醛固定活l细胞或者组织的方法,因此能比较真实的反映细胞内tf与promoter的结合情况,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。近年来,这种技术得到不断的发展和完善。采用结合微阵列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活性,是深入分析癌l症、心血l管病以及中央神经系统紊乱等---主要通路的一-种非常有效的工具。

染色质免l疫沉淀分析(chip) 的基本原理是在活l细胞状态下,当用甲醛处理时,相互靠近的蛋白与蛋白、蛋白与---(dna或rna)之间会产生共价键。细胞内,当f与promoter相互结合时,荧光定量pcr,它们必然靠的比较近或者契合在一起,这个时候用甲醛处理,能使它们之间产生共价键。固定的蛋白质dna复合物通过超声或酶处理将其随机切断为-定长度范围内的染色质小片段然后通过抗原抗l体的特---识别反应沉淀此复合体,特---地富集目的蛋白结合的dnal片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与dna相互作用的信息。通过qpcr或二代测序,筛选与目的蛋白互作的未知dna信息。





rna提取预备工作

rna酶(rnase)是导致rna降解主要的物质。此酶非常稳定,在一些的条件下只可暂时失活,但---因素去除后又迅速恢---性。常规高温高压灭菌方法和蛋白抑制ji不能使所有的rnase完全失活。

1.它广泛存在于人的皮肤上,pcr引物设计,因此制备rna时必须戴手套

2.rnase的又一污染源是取液器。根据取液器制造商的要求对取液器进行处理。一般情况下采用以depc配制的70%---擦洗取液器的内部和外部,实时定量pcr,可基本达到要求。

3. 塑料制品、玻璃和金属物品的处理

(1)塑料制品:尽量使用---无菌塑料制品。已标明rnase-free的塑料制品,如没有开封使用过,通常不必再处理。



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