实时荧光定量pcr-英瀚斯-甘孜pcr

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    2023-7-20

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染色质免l疫共沉淀技术(chip)

基于体内分析而发展的染色质免l疫沉淀分析chr omat in immunoprecipitat ionassay kit, chip)技术可以真实、完整地反映结合在dna序列上的调控蛋白。由于chip采用甲醛固定活l细胞或者组织的方法,因此能比较真实的反映细胞内tf与promoter的结合情况,甘孜pcr,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。近年来,这种技术得到不断的发展和完善。采用结合微阵列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活性,是深入分析癌l症、心血l管病以及中央神经系统紊乱等---主要通路的一-种非常有效的工具。

染色质免l疫沉淀分析(chip) 的基本原理是在活l细胞状态下,当用甲醛处理时,相互靠近的蛋白与蛋白、蛋白与---(dna或rna)之间会产生共价键。细胞内,当f与promoter相互结合时,它们必然靠的比较近或者契合在一起,这个时候用甲醛处理,能使它们之间产生共价键。固定的蛋白质dna复合物通过超声或酶处理将其随机切断为-定长度范围内的染色质小片段然后通过抗原抗l体的特---识别反应沉淀此复合体,特---地富集目的蛋白结合的dnal片段,通过对目的片断的纯化与检测,实时荧光定量pcr,从而获得蛋白质与dna相互作用的信息。通过qpcr或二代测序,pcr检测,筛选与目的蛋白互作的未知dna信息。





蛋白质双向电泳实验流程

1.---yi酸-bing酮沉淀法提取蛋白

2.双向电泳分离待测样品

(1)一相等电---前处理按照所用仪器的厂商提供操作手册进行。蛋白质上样浓度不要超过10mg/ml,否则会造成蛋白质的---或沉淀。

(2)等电---完毕后(约需24hr),若不立即进行第二相电泳,胶条可夹在两层塑料薄膜中于-70℃保存数月。

(3)等电---好的胶条按厂商提供的操作手册平衡两次。平衡完毕后,于电泳仪上用12.5%sds-page凝胶进行电泳分离。仪器设置为2.5w/胶 45min,15w/胶 5-8hr,20℃。

3.银染法对凝胶进行染色

(1)固定(2)清洗(3)增敏(4)清洗(5)染色(6)清洗(7)显影(8)定影(9)水洗

3.凝胶扫描及图像分析

(1)图像扫描:凝胶染色后采用image scanner以300dpi,16-bit模式(65536灰阶)进行扫描。

(2)图像分析:扫描完毕后,凝胶继续置于1%yi酸中于4℃保存。扫描后的图像用imagemaster 2d platinum software软件进行分析。分析按照软件厂商提供的说明书进行。以zui小点面积30,荧光定量pcr,平滑度2为主要参数zui大限度检测蛋白质点。以目标蛋白质3个重复具有相同趋势,目标蛋白质相邻位点的相对一致性,至少2个重复有2倍以上差异作为判定差异表达蛋白质的标准。







二、大肠菌群检验方法:

由于大肠菌群指的是具有某些特性的一组与粪便污染有关的---,即:需氧及兼性厌氧、在37°c能分解乳糖产酸产气的革兰氏阴性无芽胞。因此大肠菌群的检测一般都是按照它的定义进行。 目前国内采用的进出口食品大肠菌群检测方法主要有和原商检局制订的行业标准。两个标准方法在检测程序上略有不同。

(一):采用三步法,即:乳糖发酵试验、分离培养和证实试验。乳糖发酵试验:样品稀释后,选择三个稀释度,每个稀释度接种三管乳糖胆盐发酵管。36士1c培养48土2h,观察是否产气。分离培养:将产气发酵管培养物转种于伊红美蓝琼脂平板上,36士1°c培养18-24h,观察菌落形态。证实试验:挑取平板上的菌落,进行革兰氏染色观察。同时接种乳糖发酵管36士1°c培养24土2h,观察产气情况。

报告:

根据证实为大肠阳性的管数,查mpn表,报告每100ml ( g)大肠菌群的mpn值。具体操作参见gb4789. 3-94 <------食品卫生微生物学检验大肠菌群测定>

(二)原商检局制订的行业标准,等效采用美国fda的标准方法,用于对出口食品中的大肠进行检测。本方法采用两步法:推测试验:样品稀释后,选择三个稀释度,每个稀释度接种三管lst肉汤。36士1c培养48士2h,观察是否产气。证实试验:将产气管培养物接种煌绿乳糖胆盐(bglb)肉汤管中,36士1°c培养48士2h,观察是否产气。以bglb产气为阳性。查mpn表,报告每ml(g)样品中大肠菌群的mpn值。具体操作参见sn0169-92<------进出口商品检验行业标准 出口食品中大肠菌群、粪大肠菌群和大肠检验方法>





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